教會簡史教會設立：主後 1968 年 7 月 7 日
教會升格：主後 1972 年 7 月

七星中會傳道部鑒於本市南京東路四段以北尚未有教會，實有需要早日開設教會。委派傳道部長吳天賜牧師及台灣神學院教授黃主義牧師籌備教會事宜，於一九六八年五月 在南京東路四段一八一號租屋開設佈道所，同年七月七日舉行「開設佈道所開幕典禮」感恩禮拜。吳天賜牧師為首任小會議長，黃主義牧師及師母兼理牧會。

因路邊噪音過大。十一月遷移會所到南京東路四段一三三巷四弄三十號，一九六九年成立聖歌隊及青年團契。一九七0年七月黃主義牧師夫婦出國離任，林義宏傳道師接任，兼牧一年。

一九七二年七月昇格為堂會。八月第一任牧師袁鄒富來牧師就任。袁牧師就任後積極牧養工作。為教會之未來發展，同年十月購買南京東路四段一三 三巷六弄二0、二二號現址為禮拜堂，並成立財團法人台北市金陵基督長老教會。

一九七九年四月為紀念本會設教十週年，開設城東佈道所。同時派本堂陳正憲副牧師駐城東教會牧會。一九八五年六月三十日舉行袁鄒富來牧師牧會四十八週年盡程退休感恩禮拜，並聘為名譽牧師。一九八六年十月聘葉勝文牧師、吳淑金牧師為第二任主任牧師及牧師。一九八八年七月舉行二十週年感恩及教育館獻堂典禮。

一九九0年十一月十四日葉勝文牧師安息主懷，同年十二月中會派詹燦東牧師，於禮拜中宣佈吳淑金牧師正式接任本會小會議長。一九九一年九月吳淑金牧師辭任。同年七星中會派廖恩加牧師自十月起接任本會小會議長。一九九二年十一月聘羅順定牧師為第三任牧師。一九九二年成立社青團契。

一九九五年小會將教會事工，分為禮拜、傳道、主日學、團契、總務、關懷、服務和財務八組。同年七月小會決議續聘 羅順定牧師。一九九七年十二月成立路得團契。一九九八年起將家樂團契改為兄弟團契。

一九九八年設教三十週年，並於七月五日下午舉行「台灣基督教長老教會金陵教會設教三十週年感恩禮拜」。2008 年教會設教四十週年並繼續關心社區宣教事工。