蘭陽基督長老教會於台灣傳道百年倍加運動時，由母會宜蘭基督長老教會分設。斯時，傳道師林玉田先生，小會議長張逢昌牧師，李兆蕙、李鍾善心、張坤鐘、王煥章等四名長老，及林維國、陳蔡玉鑾、張葉秀梅等三名執事，信徒共三十一名，於一九六一年九月廿七日暫借張坤鐘長老新建房屋樓下舉行分設首次聖日崇拜，於十月一日正式由中會宣佈舉行蘭陽基督長老教會正式成立盛典。設立教會第七年，由蕭江祥傳道師接續牧會。一九六八年七月，蘇光洋傳道師駐任本會牧會，於一九七○年八月廿四日設置信德獎學金，並築竣新穎禮拜堂及牧師館，舉行禮拜堂獻堂禮拜。一九七二年六月聘許志三牧師為首任牧師，築竣青年活動中心，開辦信愛幼稚園。

一九八八年聘陳宇碩牧師為第二任牧師，成立獎學金暨基金管理委員會，執行管理信德獎學金、服事獎學金、張紹宗長老夫婦紀念獎學金、建設基金、開拓基金、慈善基金等事工。一九九一年八月停辦幼稚園，修建教會空間。一九九一年十二月成立教會詩班，一九九三年成立社青小組，合併弘恩差傳獎學金及林維國紀念獎學金為蘭陽教會差傳獎學金，並於一九九四年將社青小組改為社青團契，夫婦團契改名為蘭陽教會信愛成人團契。一九九五年設置蘭陽教會專案助學金，幫助家庭未提供經費支持之本教會神學生。一九九六年成立吳宜珊紀念基金，致力兒童意外事故之救助與防治。

一九九七年聘吳恩情牧師為第三任牧師，一九九九年成立學青小組，加強大專福音事工。因教會事工順利推展，信徒增多，主日禮拜人數超過一百名。有感於教育訓練之重要，成人主日學陸續開課，並拓展得勝者事工，以開拓福音事工的層面。